產(chǎn)品編號 | C6207 |
英文名稱 | Animal Cell/Tissue Genome Extraction Kit |
中文名稱 | 動物組織/細(xì)胞基因組DNA提取試劑盒 |
別 名 | 超強(qiáng)通用型基因組DNA提取試劑盒; |
克 隆 號 | |
CAS | |
理論分子量 | kDa |
檢測分子量 | |
保存條件 | 室溫干燥可保存一年。 |
注意事項(xiàng) | This product as supplied is intended for research use only, not for use in human, therapeutic or diagnostic applications. |
產(chǎn)品介紹 |
產(chǎn)品簡介 本試劑盒適合于從新鮮或冷凍的動物組織(比如鼠尾、肝臟等),細(xì)胞,血液,細(xì)菌等多種樣品中提取高純度總DNA。本品可純化獲得分子量最大為50kb的DNA片段,純化過程不需要使用苯酚或氯仿等有毒溶劑,無需乙醇沉淀。本試劑盒采用優(yōu)化的緩沖體系使裂解液中的DNA高效特異的結(jié)合到硅基質(zhì)離心吸附柱上,PCR和其他酶促反應(yīng)的抑制劑可通過兩步洗滌步驟被有效去除,最后使用低鹽緩沖液或水洗脫,即可得到高純度DNA。純化得到的DNA可以直接用于酶切,PCR,Real-Time PCR,文庫構(gòu)建,Southern Blot,分子標(biāo)記等下游實(shí)驗(yàn)。 產(chǎn)品組份 Buffer GTL: 12 ml (50T) Buffer GL: 12 ml (50T) Buffer GW1(concentrate): 13 ml (50T) Buffer GW2(concentrate): 15 ml (50T) Buffer GE: 7 ml (50T) Proteinase K** : 1 ml (50T) Spin Columns DM with Collection Tubes: 50個(gè) (50T) ** Proteinase K(蛋白酶K):-20℃保存,開蓋后防止空氣及槍頭污染,如果出現(xiàn)絮狀 物,是因?yàn)槿芙饩彌_液中的鈣離子在磷酸鹽中可能會產(chǎn)生不溶解性沉淀,離心取上清,不影響使用效果。 自備試劑 無水乙醇;Enzymatic Lysis Buffer(提取革蘭氏陽性菌基因組DNA時(shí)須準(zhǔn)備)。 Enzymatic Lysis Buffer 配方:20 mM Tris,pH 8.0;2 mM Na2-EDTA;1.2%Triton X-100;終濃度為20mg/ml的Lysozyme(溶菌酶)。 實(shí)驗(yàn)前準(zhǔn)備及重要注意事項(xiàng) 1. 樣品應(yīng)避免反復(fù)凍融,否則會導(dǎo)致提取DNA片段較小且提取量下降。 2. 如果提取次生代謝產(chǎn)物大量積累或細(xì)胞壁厚的細(xì)菌培養(yǎng)物的基因組,建議在對數(shù)生長期早期收集樣品。 3. 第一次使用前應(yīng)按試劑瓶標(biāo)簽的說明在Buffer GW1和Buffer GW2中加入無水乙醇。 4. 使用前請檢查Buffer GTL和Buffer GL是否出現(xiàn)結(jié)晶或沉淀,如有結(jié)晶或沉淀,請將Buffer GL和Buffer GTL于56?C水浴重新溶解。 5. 如果下游實(shí)驗(yàn)對RNA污染比較敏感,可以在加入Buffer GL前加入4μl DNase-Free的RNase A(100mg/ml),RNase A 本試劑盒并未提供,可單獨(dú)訂購。 操作步驟 血液及細(xì)胞樣本基因組提取 1. 材料處理 a) 如果提取材料為哺乳動物抗凝血液(無核紅細(xì)胞),可直接向50-200μl新鮮或冷凍的抗凝血液樣品中加入Buffer GTL補(bǔ)足至200μl。 b) 如果提取材料為禽類,鳥類,兩棲類或更低級生物的抗凝血液,其紅細(xì)胞為有核細(xì)胞,取5-10μl新鮮或冷凍的抗凝血液樣品,加入Buffer GTL補(bǔ)足至200μl。 c) 貼壁培養(yǎng)的細(xì)胞應(yīng)先處理為細(xì)胞懸液(最大提取量為5x106個(gè)細(xì)胞),2000 rpm(400xg)離心5分鐘,棄盡上清,加200μl GTL,振蕩至樣品徹底懸浮。 注意:如需去除RNA,可在上述步驟完成后,加入4μl濃度為100mg/ml的RNase A 溶液,渦旋15秒,室溫放置2分鐘。 2. 加入20μl Proteinase K 溶液,混勻。 3. 加入200μl Buffer GL,渦旋振蕩充分混勻,56?C水浴10分鐘。 4. 短暫離心以去除管蓋內(nèi)壁的水珠。加入200μl無水乙醇,渦旋振蕩充分混勻,短暫離心。 注意: 1)加入Buffer GL和無水乙醇后要立即渦旋震蕩混勻。 2)加入Buffer GL和無水乙醇后可能會產(chǎn)生白色沉淀,不會影響后續(xù)實(shí)驗(yàn)。一些組織在加入BufferGL和無水乙醇后可能形成溶膠狀產(chǎn)物,此時(shí)推薦進(jìn)行劇烈震蕩或渦旋處理。 5. 上一個(gè)步驟中所得溶液全部加入到已裝入收集管的吸附柱(Spin Columns DM)中,若一次不能加完溶液,可分多次轉(zhuǎn)入。12,000 rpm(約13,400 xg) 離心1分鐘,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱重新放回收集管中。 6. 向吸附柱中加入500 μl Buffer GW1(使用前檢查是否已加入無水乙醇),12,000 rpm離心1分鐘,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱重新放回收集管中。 7. 向吸附柱中加入500 μl Buffer GW2(使用前檢查是否已加入無水乙醇),12,000 rpm離心1分鐘,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱重新放回收集管中。 注意:如需進(jìn)一步提高DNA純度,可重復(fù)步驟7。 8. 12,000 rpm離心2分鐘,倒掉收集管中廢液。將吸附柱置于室溫?cái)?shù)分鐘,以徹底晾干。注意:這一步的目的是將吸附柱中殘余的乙醇去除,乙醇的殘留會影響后續(xù)的酶促反應(yīng)(酶切、PCR等)。 9. 將吸附柱置于一個(gè)新的離心管(自備)中,向吸附柱的中間部位懸空加入50-200μl Buffer GE或滅菌水,室溫放置2-5分鐘,12000 rpm 離心1分鐘,收集DNA溶液,-20?C保存DNA。 注意: 1)如果下游實(shí)驗(yàn)對pH值或EDTA敏感,可以用滅菌水洗脫。洗脫液的pH值對洗脫效率有很大影響,若用水做洗脫液應(yīng)保證其pH值在7.0-8.5(可以用NaOH將水的pH值調(diào)到此范圍),pH值低于7.0時(shí)洗脫效率不高。 2)Buffer GE在65-70?C水浴預(yù)熱,離心之前室溫孵育5分鐘可以增加產(chǎn)量;用另外的50-200 μl BufferGE或滅菌水再次洗脫可以增加產(chǎn)量。 3)如果要提高DNA的終濃度,可將得到的溶液重新加入到吸附柱中,室溫放置2-5分鐘,12,000 rpm離心1分鐘;若洗脫體積小于200 μl,可以增加DNA的終濃度,但可能會減少總產(chǎn)量。如果DNA的量小于1 μg,推薦用50 μl Buffer GE或滅菌水洗脫。 4)因?yàn)楸4嬖谒械腄NA會受到酸性水解作用的影響,如需長期保存,推薦用Buffer GE洗脫并于-20?C保存。 動物組織基因組提取 1. 材料處理:如果提取材料為動物組織,取25 mg(脾組織用量應(yīng)少于10 mg);如果材料為鼠尾,取一段長度為0.4-0.6 cm的大鼠鼠尾或兩段長度為0.4-0.6 cm的小鼠鼠尾。 a. 樣本進(jìn)行液氮研磨或切成小塊后置于1.5 ml離心管中,加入180 μl Buffer GTL,將不同樣品做好標(biāo)記。 b. 若使用勻漿器處理樣本,勻漿前向樣本中加入不超過80 μl Buffer GTL,勻漿后加入100 μl Buffer GTL。 注意:1)確保各組織的量不要超出推薦范圍。2)組織樣本在加入Buffer GTL之前用液氮研磨或加入Buffer GTL用勻漿器勻漿處理,可以增加裂解效率。 2. 加入20 μl Proteinase K,渦旋震蕩使樣品徹底混勻。56?C水浴,直至組織完全裂解,孵育過程中可每隔一段時(shí)間顛倒或震蕩離心管使樣品分散。 注意:1)不同組織消化時(shí)間不同,通常1-3小時(shí)即可完成,鼠尾需要消化6-8小時(shí),必要時(shí)過夜消化,不會影響后續(xù)操作。2)如果孵育和渦旋震蕩后仍然有膠狀物質(zhì),延長56?C孵育時(shí)間或再加入20 μl Proteinase K消化。3)如需去除RNA,可在上述步驟完成后,加入4μl的濃度為100mg/ml的RNase A溶液,渦旋15秒,室溫放置5-10分鐘。 3. 加入200 μl Buffer GL,渦旋震蕩充分混勻,70?C水浴10分鐘。短暫離心后加入200 μl無水乙醇,渦旋震蕩充分混勻。 注意:1)加入Buffer GL和無水乙醇后要立即渦旋震蕩混勻。2)加入Buffer GL和無水乙醇后可能會產(chǎn)生白色沉淀,不會影響后續(xù)實(shí)驗(yàn)。一些組織(如脾,肺)在加入Buffer GL和無水乙醇后可能形成溶膠狀產(chǎn)物,此時(shí)推薦進(jìn)行劇烈震蕩或渦旋處理。 4. 短暫離心,將步驟3所得溶液全部加入到已裝入收集管的吸附柱(Spin Columns DM)中,若一次不能加完溶液,可分多次轉(zhuǎn)入。12,000 rpm(約13,400xg )離心1分鐘,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱重新放回收集管中。 5. 向吸附柱中加入500 μl Buffer GW1(使用前檢查是否已加入無水乙醇),12,000 rpm離心1分鐘,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱重新放回收集管中。 6. 向吸附柱中加入500 μl Buffer GW2(使用前檢查是否已加入無水乙醇),12,000 rpm。離心1分鐘,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱重新放回收集管中。 注意:如需進(jìn)一步提高DNA純度,可重復(fù)步驟6。 7. 12,000 rpm離心2分鐘,倒掉收集管中廢液。將吸附柱置于室溫?cái)?shù)分鐘,以徹底晾干。注意:這一步的目的是將吸附柱中殘余的乙醇去除,乙醇的殘留會影響后續(xù)的酶促反應(yīng)(酶切,PCR等)。 8. 將吸附柱置于一個(gè)新的離心管(自備)中,向吸附柱的中間部位懸空加入50-200 μl Buffer GE或滅菌水,室溫放置2-5分鐘,12,000 rpm 離心1分鐘,收集DNA溶液,-20℃保存DNA。 注意:1)如果下游實(shí)驗(yàn)對pH值或EDTA敏感,可以用滅菌水洗脫。洗脫液的pH值對洗脫效率有很大影響,若用水做洗脫液應(yīng)保證其pH值在7.0-8.5(可以用NaOH將水的pH值調(diào)到此范圍),pH值低于7.0時(shí)洗脫效率不高。2)Buffer GE在65-70°C水浴預(yù)熱,離心之前室溫孵育5分鐘可以增加產(chǎn)量;用另外的50-200 μl BufferGE或滅菌水再次洗脫可以增加產(chǎn)量。3)如果要提高DNA的終濃度,可將得到的溶液重新加入到吸附柱中,室溫放置2-5分鐘,12,000 rpm離心1分鐘;若洗脫體積小于200 μl,可以增加DNA的終濃度,但可能會減少總產(chǎn)量。如果DNA的量小于1 μg,推薦用50 μl Buffer GE或滅菌水洗脫。4)因?yàn)楸4嬖谒械腄NA會受到酸性水解作用的影響,如需長期保存,推薦用Buffer GE洗脫并于-20°C保存。 細(xì)菌基因組提取 1. 細(xì)菌樣本預(yù)處理 1a. 革蘭氏陰性菌 (1)取細(xì)菌培養(yǎng)物1-5 ml(106-108個(gè)細(xì)胞,最多不超過2×109個(gè)細(xì)胞)置于離心管(自備)中,12,000 rpm(~13,400xg)離心1分鐘,盡量吸凈上清。 (2)向沉淀中加入180 μl Buffer GTL,振蕩使菌體重懸。 (3)加入20 μl Proteinase K,渦旋混勻,56°C孵育,直至菌體完全裂解,孵育過程中每隔一段時(shí)間顛倒或震蕩離心管使樣本分散。 注意:如需去除RNA,可在上述步驟完成后,加入4 μl濃度為100 mg/ml 的RNase A溶液,震蕩混勻,室溫放置5-10分鐘。 (4)加入200 μl Buffer GL,渦旋震蕩混勻。 1b. 革蘭氏陽性菌 (1)取細(xì)菌培養(yǎng)物1-5 ml(106-108個(gè)細(xì)胞,最多不超過2×109個(gè)細(xì)胞)置于離心管(自備)中,12,000 rpm離心1分鐘,盡量吸凈上清。 (2)加入180 μl Enzymatic Lysis Buffer(自備)使菌體重懸。 (3)37°C孵育30分鐘。 (4)加入20 μl Proteinase K渦旋震蕩,充分混勻。加入200 μl Buffer GL,渦旋震蕩混勻。56℃孵育30分鐘。 注意:1)如果需要,95°C孵育15分鐘可以使病原體失活,但是95°C孵育會造成一些DNA的降解。2)如需去除RNA,可在上述步驟完成后,加入4 μl濃度為100 mg/ml 的RNase A溶液,震蕩混勻,室溫放置5-10分鐘。 2. 加入200 μl無水乙醇,渦旋震蕩充分混勻。 注意:加入無水乙醇后可能會產(chǎn)生白色沉淀,不會影響后續(xù)實(shí)驗(yàn)。 3. 將步驟2所得溶液(包括形成的沉淀)全部加入到已裝入收集管的吸附柱(SpinColumns DM)中,若一次不能加完溶液,可分多次轉(zhuǎn)入。12,000 rpm離心1分鐘,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱重新放回收集管中。 4. 向吸附柱中加入500 μl Buffer GW1(使用前檢查是否已加入無水乙醇),12,000 rpm離心1分鐘,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱重新放回收集管中。 5. 向吸附柱中加入500 μl Buffer GW2(使用前檢查是否已加入無水乙醇),12,000 rpm離心1分鐘,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱重新放回收集管中。 注意:如需進(jìn)一步提高DNA純度,可重復(fù)步驟5。 6. 12,000 rpm離心2分鐘,倒掉收集管中廢液。將吸附柱置于室溫?cái)?shù)分鐘,以徹底晾干。 注意:這一步的目的是將吸附柱中殘余的乙醇去除,乙醇的殘留會影響后續(xù)的酶促反應(yīng)(酶切、PCR等)。 7. 將吸附柱置于一個(gè)新的離心管(自備)中,向吸附柱的中間部位懸空加入50-200 μl Buffer GE或滅菌水,室溫放置2-5分鐘,12,000 rpm離心1分鐘,收集DNA溶液,-20°C保存DNA。 注意: 1)如果下游實(shí)驗(yàn)對pH值或EDTA敏感,可以用滅菌水洗脫。洗脫液的pH值對洗脫效率有很大影響,若用水做洗脫液應(yīng)保證其pH值在7.0-8.5(可以用NaOH將水的pH值調(diào)到此范圍),pH值低于7.0時(shí)洗脫效率不高。 2)Buffer GE在65-70°C水浴預(yù)熱,離心之前室溫孵育5分鐘可以增加產(chǎn)量;用另外的50-200 μl Buffer GE或滅菌水再次洗脫可以增加產(chǎn)量。 3)如果要提高DNA的終濃度,可將得到的溶液重新加入到吸附柱中,室溫放置2-5分鐘,12,000 rpm離心1分鐘;若洗脫體積小于200 μl,可以增加DNA的終濃度,但可能會減少總產(chǎn)量。如果DNA的量小于1 μg,推薦用50 μl Buffer GE或滅菌水洗脫。 4)因?yàn)楸4嬖谒械腄NA會受到酸性水解作用的影響,如需長期保存,推薦用Buffer GE洗脫并于-20℃保存。 |